RFID系统的前端软件（前台软件）和中间件的主要作用是对数据进行收集和整理，最终对数据进行记录，而实现企业管理功能的是其后端软件（后台软件或应用软件）。由于信息是为生产决策服务的，所以RFID系统所采集的信息最终要向后端软件传送，后端软件系统需要具备相应的处理RFID数据的功能。后端软件的具体数据处理功能和结构需要根据客户的具体需求和决策的支持度来进行设计。
      就目前的应用而言，RFID系统的后端软件既有针对高端市场的，也有为中、小企业开发的。它大致可以分成两类，用于实现最基本记录分析功能的软件和企业资源规划应用中的应用软件。前者的主要应用有门禁管理软件、小区停车管理软件等，由于其功能较少，成本较低，所以很多都作为硬件设备的附赠品提供给公司用户使用。后者主要用在企业资源计划（Enterprise Resource Planning，ERP）系统的概念软件上，外加了RFID功能或进行了一些改造后的ERP软件，因此其价格很难固定，主要取决于企业的规模和软件模块的数量。
采用RFID技术的后端管理软件大致可以分为以下3种情况。
（1）采用RFID技术之前，企业或公司内部都有自己的管理软件系统，这些系统的数据可能是手工输入或者通过条形码识别系统输入的。如果该程序的数据接口定义良好，则RFID中间件的设计将会非常简单，这样数据对于后端软件将会变得透明。

（2）如果后端管理软件的接口定义得不够完美，则需要重新修改才能接受RFID中间件提供的规格化数据。
（3）大多数情况下，RFID的数据模式在过去的企业系统中尚未有过，因此需要重新开发或购买。
     后端管理软件由中心数据服务器和管理终端组成，是系统的数据中心，它负责与读写器通信，将读写器经过中间件转换之后的数据插入后台业务仓库管理系统的数据库中，对电子标签管理信息、电子标签和采集的电子标签信息集中进行存储和处理。一般来说，后端管理软件需要完成以下功能。
（1）RFID系统管理：系统设置及系统用户信息和权限的设置。
（2）电子标签管理：在数据库中管理电子标签序列号和每个物品对应的序号和产品名称、型号规格、芯片内记录的详细信息等，完成数据库内所有电子标签的信息更新。
（3）数据分析和储存：对整个系统内的数据进行统计分析，生成相关报表，并对采集到的数据进行存储和管理